IVL:s Oljejour har genom sitt arbete med miljömål, miljökonsekvensbeskrivningar och oljeskyddsarbete, tillsammans med Naturvårdsverket, Räddningsverket och Kustbevakningen, sett ett behov av en digital nationell miljöatlas för Sveriges kustområden och de större inlandsvattnen. Detta expertstödsystem kan bland annat användas som ett operationellt verktyg för att underlätta samordning och styrning av regionala myndigheters insatser i syfte att minska miljöeffekter av olje- och kemikalieutsläpp i vatten. På uppdrag av Naturvårdsverket har IVL Svenska Miljöinstitutet tillsammans med Länsstyrelsen i Västra Götaland, under perioden 2003-2007, arbetat med att ta fram en fungerande pilot-applikation. Under pilotperioden har en lösenordsskyddad, dock publik, betaversion av Miljöatlas funnits på internet www.gis.lst.se/ivl. Miljöatlas kommer att officiellt lanseras i september 2008. Som teknisk plattform för Miljöatlas används det av länsstyrelsen i Västra Götalands län utvecklade systemet för presentation av kartmaterial på internet. Detta dokument är en manual som beskriver de verktyg och funktioner som finns i Miljöatlas. Manualen finns tillgänglig digitalt i Miljöatlas.