Detta projekt har utvecklat metoder och verktyg för att förbättra förmågan att kunna dra konklusiva slutsatser vid analys av prover med okänt innehåll som kan innehålla smittämnen associerade med allvarlig sjukdom. Projektet har använt sig av den nya generationens DNA sekvenseringsteknologi och ett stort fokus har lagts vid att utveckla och utvärdera dataanalysmetoder för att ge bästa möjliga beslutsunderlag. Speciellt har fokus lagts på att kunna skilja på högriskorganismer och de betydligt mindre farliga nära släktingar som finns spridda i vår omgivning och som kan skapa stora beslutssvårigheter vid bedömningen av resultaten. Detta har gjorts genom att genomsignaturer identifierats som med stor tillförlitlighet signalerar att alvarliga smittämnen finns närvarande. Projekt har skapat verktyg som ökat vår förmåga att, vid en oklar hotbild med misstanke om biologiskt hot, kunna göra en tillförlitlig förutsättningslös analys av prover som ställer en öppen fråga "vad finns i provet", snarare än en serie specifika frågor "finns det detta i provet?, finns det detta i provet?, finns det detta i provet?, etc... Vidare har fokus lagts vid att skapa en så komplett lösning som möjligt, dvs, från provtagning, till sekvensering, till dataanalysen, till tolkningen, till rapporteringen och framförallt visualiseringen av resultaten.