Naturgas är ett rent bränsle som endast innehåller små mängder föroreningar. Jämfört med kol är förekomsten av föroreningar i naturgas vanligen 1000 ggr mindre. Man får därför inga problem med svaveldioxid, tungmetaller, klorerade föreningar etc i avgaserna. Vid normal drift bildas mycket lite sot, och de huvudsakliga förbränningsprodukterna är vatten och koldioxid. Vatten ställer normalt inte till några problem, om avgaskanalen är rätt utformad. Koldioxid betraktas som en miljögas, men utsläppet från naturgas är per energienhet lägre än för andra bränslen.